Werder Bremens Aufsichtsrat besteht aus sechs Mitgliedern. Bei der Mitgliederversammlung am 21. November 2016 wurde die Hälfte der Mitglieder neu gewählt.
Zwei der Aufsichtsrat-Mitglieder werden vom Verein bestimmt, vier in der Mitgliederversammlung gewählt - zusätzlich zu den drei neuen, wurde auch Marco Bode wieder in seinem Amt bestätigt.